「超能干探」描寫兩位至交好友,陳一賢(郭晉安飾)及方志強(劉錫明飾),兩人至同道合一起考進了警察學校,后又分發到同一單位服務。 強生性善良沒有心機,但處事有原則,不愿隨波逐流,因此屢遭局內同僚排斥。而好友賢則恰相反,他聰明機伶,做人有手腕、心機深,起嫉妒心重,為了名利不擇手段,因此很受同事長官器重。 一次,強在緝捕行動中受傷,子彈貫穿心肺之間,奇跡式的存活下來,但卻從此產生了「超能力」。強連自己也不太能理解為什么能夠「以眼代手」、「移形換影」或「電磁效應」。幸有一位奇人沈節(谷峰飾),教強控制自己的超能力。 強與賢在一次緝捕歹徒的行動中,驚險萬分,賢不慎受槍傷,而強則在危機中,不知不覺的使用了超能力逮捕獲歹徒,強因而升職。 阮雯原為賢之女友,她一心一意守在賢身旁,但賢卻因自私多次冷落阮雯,令阮雯若有所失。強自小暗戀雯,乃不時給予鼓勵;雯不受賢重視,找強傾吐,兩人愛苗漸滋生。 賢嫉妒強的升職,雯又向賢提出分手,并坦言愛上賢,賢因此更加憤恨。強被長官指派為誘餌,險象環生中又以超能力捕獲歹徒,此時,高人石龍(王龍威飾)出現,以高強的功力將歹徒滅口。 賢親眼目睹石龍的超能力,乃告知強,強一時大意,將子己擁有超能力之事坦言告之;賢乃求見沈節,沈節一眼看穿賢心術不正,勸他勿接近石龍,以免誤入魔道。 但賢因公事不順遂,巧遇石龍,石龍引誘他做徒弟,賢名利薰心,開始向石龍學習超能力。 馬鳳兒(彭家麗飾)因偶然的機會,認識了強的母親關靜紅(蘇杏璇飾),兩人頗為投緣,紅不但將鳳兒帶回家,并要強照料鳳兒。鳳兒刁鉆活潑,初時常捉弄強,但逐漸了解強的忠厚后,漸愛上強。賢因得知鳳兒顯赫的身世,利用強結識鳳兒,賢漸對鳳兒產生情愫,但鳳兒卻對賢沒感覺,唯對強情有獨鐘。而雯雖屢遭鳳兒言語及行動騷擾,卻始終默默忍受。 賢與強被分為不同的二組,共同打擊犯罪。但兩組組長處事不合,導致兩組人馬處處搶功;在共同追查一樁重大刑案時,石龍因參與其中,龍要脅賢干出殺人勾當,自此,賢身陷魔道而不能自拔。 強之師父沈節原是大陸公安,來港為逮捕超能力高人石龍回大陸受審。強在不屈不撓的追查下,真相逐漸被解開,正當他掌握罪證據,卻被石龍攔截,龍正要向強下毒手時,幸好沈節趕到,雖打走了龍但卻身受重傷。鳳兒也為了救強而犧牲了生命。 賢怕自己的事跡敗露,不斷以超能力殺人,并設計陷害強,強雖知賢種鐘惡行,但顧念往惜情誼,不愿與賢決裂。 龍見賢事跡敗露,認為賢已無利用價值,欲殺賢,幸得強與節搭救。賢不知悔改,反而悟得更深之魔法,將石龍除去,并做惡不斷。 強忍無可忍,故意將雯遣至美國,并將紅送回鄉下,在無后顧之憂后,痛下決定和賢展開一場生死大對決.....。