隨著和平的到來而走向近代化的木葉忍者村。高樓林立，巨大顯示屏中播放出影像，連結各區域的電車在村里奔馳。雖說是忍者村，但一般民眾也增多，忍者的生存方式也在逐漸改變的這個時代——　　村子的領袖，第七代火影·漩渦鳴人的兒子慕留人，進入了培育忍者的學校“忍者學?！?。周圍的學生們帶著“火影的兒子”這樣偏見的目光看待慕留人，但慕留人憑借天生的破天荒性格將這種小事輕松越過！　　慕留人與新的伙伴相遇，他將如何挑戰突然發生的神秘事件？　　在眾人心中如疾風般狂奔的“漩渦慕留人”的物語，現在開始！！